1．放卵放精（演示5分）
　授業開始とともに，水槽から雌雄と思われる２個体を選びだし，海水を満たしたショウジョウバエ飼育用の管びん上に口器を取り除いて逆さまにおく。バフンウニの雌雄の見分け方は，実験参考書などには記載されてないが，水槽の壁面をとおしてみて，管足がややピンク色をしたものがメスで，白っぽいものがオスである傾向が見られる。体内にKClを溢れるぐらいに注射器で入れると，すぐに放卵（放精）が見られる。
2．受精（５〜10分）
　管の底にたまった卵をビーカーにとり海水で薄めて，生徒が観察する時計皿にとり分ける。精子はごく薄くなるよう海水で薄めて，プラスチックのスポイトに入れ観察班ごとにわけて生徒に渡す。生徒はまず未受精卵を観察し，続いて精子のけん濁液を一滴時計皿に入れ，卵に群がる精子のべん毛の運動と，受精膜形成の様子を観察する。
3．卵割（5〜10分）
　受精膜の観察を終えた生徒は，時計皿の内容物を捨てて，当該授業の１つ前のクラスの授業時に受精させた受精卵を観察する。バフンウニの発生の経過時間は，水温によってほぼ決まっており，19〜20℃の場合，受精から１時間くらいで第一卵割が始まる。ほとんど全ての卵が数分の間に卵割を終えるので，卵にくびれが入り，完全に２つの割球になるまでの過程が観察できる。同様の方法で，授業時間から遡って時間を調整し受精させておけば，第２，第3卵割などの瞬間も観察することができる。（表）

4．胚（25〜35分）
　卵割と同様あらかじめ受精させておくことで様々なステージの胚を観察することができる。前日，前々日の授業で受精させた受精卵は，大形（１〜２リットル）のビーカーに入れておき，暖房の有る無しなど，置き場所を工夫して発生にかかる時間を調節する。生徒は，実験室に準備した大形のビーカーから各自スポイトで時計皿に幼生をとり，顕微鏡で観察する。この際，ビーカーには受精の日付けと時刻のみを記入しておき，生徒自身にどのステージの胚であるかを確認させ，胚発生にかかる時間を考えさせてもよい。本校では通常，胞胚からプルテウスまで５〜６ステージの胚を用意してある。この段階では，生徒に観察班ごとに分担して観察させるとスムーズに観察することができる。
　この観察においては，なるべく多くの生きた発生のステージを観察させることに重点をおくので，あまり詳しいスケッチは要求しない。また，授業時間に十分観察できなかった生徒に対して，休み時間や放課後に実験室を解放している。